Estimada Stella, 

Vos indicás "... el contador no descuenta la diferencia del parcial de la obra social, que debe aportar por 8 horas, porque considera que con lo que aporta cubre el importe total, pero sumando en el bruto casi 30 años de servicio" y esto es bastante sencillo de resolver: si el total bruto del trabajador -asumo que es de 4º categoría- es superior a $19.975 (Escala salarial de agosto de 2018) ya supera el monto mínimo por el cual se debería descontar la obra social; si es menor, hay que descontar el 3% de $19.975.

Con respecto al bono abonado en 3 cuotas de $2.000 no remunerativos era para todas las categorías y funciones. La resolución no hablaba de pagos proporcionales a las categorías que no son menualizadas. Aunque no parece ser lógico, así lo dispuso la normativa en cuestión: Resolución 126/2018.

Con respecto a las obligaciones a abonar, no me queda claro qué es lo que no está abonando, no sé si te referís al curso del SERACARH o a otro concepto, pero no es cuestión de hacerle abonar menos al consorcio sino de lo que corresponde o no.

Te mando un saludo grandote.